Boarding school MTsN 1 Kota Bima didirikan pada tanggal 16 Juni 2012 dengan nama MTsN Bima 1 Boarding School yang menempati lokasi di gedung MTsN negeri 1 Kota Bima. Jumlah Santri boarding school MTsN Bima 1 pada angkatan pertama tahun ajaran 2012/2013 sebanyak 16 Santri dan mayoritas pengajarnya adalah guru-guru MTsN Bima 1 serta guru-guru dari luar yang memiliki kemampuan dibidangnya.
MTsN Bima 1 boarding school terintegrasi dalam MTsN Bima 1 dengan pengelompokan kelas pembelajaran putra dan putri yang terdiri dari satu kelas untuk putra dan satu kelas untuk putri sehingga jumlah kelas keseluruhan dua kelas.